Ikerketa burutzen da, kronikotasunaren aurrean hainbat esku-hartze maila lantzen dituzten ikerketa zientifikoko 6 programaren bitartez. Horietako batzuk, gainera, hainbat azpiprogramatan banatzen dira:

1. Biztanleriaren ikuspegia. 
1.1. Epidemiologia, osasunean desberdintasunak eta kronikotasunak osasunean duen eragina. 
1.2. Estratifikazioa eta modelizazioa. 
2. Prebentzioa eta sustapena. 
3. Gaixoaren autonomia.
4. Arreta jarraitua.
4.1. Antolaketa-berrikuntza. 
4.2. Arretaren ebaluazioa eta kalitatea. 
4.3 Kronikotasunaren kudeaketa klinikoa. 
5. Egokitutako esku-hartzeak. 
5.1. Teknologia berriak gaixotasun kronikoen tratamenduan. 
5.2. Esku-hartze eta tratamendu psikosozialak kronikotasunean. 
5.3. Sendagaien erabilera. 5.4. Produktu eta teknologia berrien garapena. 
6. Osasun arloko emaitzen ikerketak. 
6.1. Emaitzen ebaluazioa.
6.2. Ikerketa metodoak eta tresnak. 

Kronikgunek 31 ikerketa talde ditu ikertzen, Euskal Osasun Sareko 300 ikertzaile inguru guztira