El Instituto Kronikgune busca avanzar en la evaluación de políticas y servicios de salud, el desarrollo de modelos de intervención, la diseminación y el análisis del cambio, y la implementación en los servicios de salud, que permitan una mayor eficacia, equidad, eficiencia, y seguridad del sistema de salud.

Las líneas de investigación del Instituto Kronikgune se centran en tres campos:
– La evaluación de servicios sanitarios.
– El diseño y evaluación de nuevas intervenciones.
– La implementación y su evaluación.

El Instituto Kronikgune se configura en torno a cuatro áreas de investigación transversales: